Süper Lig'in 33'üncü haftasında Kayserispor'un Kasımpaşa'yı mağlup etmesiyle UEFA Avrupa Ligi'ne gitmeyi garantileyen yeşil beyazlılar, sahasında aldığı Eskişehirspor beraberliğiyle ligin bitmesine 1 hafta kala Beşiktaş'ın 4 puan gerisinde kalarak üçüncülük umutlarını yitirdi. Sezonu dördüncü sırada bitiren Bursaspor'un oynayacağı ön eleme sayısı, 22 Mayıs'ta Trabzonspor ile Fenerbahçe arasında oynanacak kupa finalinden sonra kesinleşecek.
Türkiye Futbol Federasyonu, Süper Lig 2012-2013 Sezonu Statüsü'nde Türkiye Kupası şampiyonu olan takımın UEFA Avrupa Ligi'ne gidecek 1'inci takım, Süper Lig'i 3'üncü sırada bitirecek ekip 2'nci takım, ligi 4'üncü sırada bitiren takımın 3'üncü takım olacak. Kupa şampiyonu olan takımın Şampiyonlar Ligi'ne gitmeye hak kazanması halinde sıralama değişecek. Bu durumda Süper Lig'i 3'üncü sırada bitiren takım UEFA Avrupa Ligi'ne gidecek 1'inci takım, ligi 4'üncü sırada bitiren takım 2'nci takım, kupa finalisti ise 3'üncü takım olacak.
Buna göre; Türkiye Kupası'nı kazanan takımın Fenerbahçe olması halinde Bursaspor, Beşiktaş'ın ardından Avrupa'ya giden ikinci takım olacak ve 1 ön eleme, 1 play off maçı oynayacak. Kupayı müzesine götüren takımın Trabzonspor olması durumunda ise yeşil beyazlılar, Avrupa Ligi'ne Türkiye Süper Ligi'nden katılacak son takım olacak ve 2 ön eleme, 1 play off maçı yapacak.
UEFA tarafından belirlenen 2013-2014 Sezonu Avrupa Ligi maç takviminde ise 2'nci ön eleme maçlarının 18-25 Temmuz 2013, 3'üncü ön eleme maçlarının ise 1-8 Ağustos 2013 tarihlerinde oynanacağı belirtildi.